Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG7P83436 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG7P83436 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG7P83436 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COG7P83436 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms