Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms