Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms