Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms