Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms