Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms