Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCLCP48506 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCLCP48506 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCLCP48506 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCLCP48506 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCLCP48506 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCLCP48506 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms