Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRXP46100 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms