Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms