Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms