Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF5P43026 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDF5P43026 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms