Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms