Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms