Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFNP31947 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFNP31947 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFNP31947 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFNP31947 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms