Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms