Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms