Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX2P28328 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms