Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DMAP28067 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms