Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF1P22415 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF1P22415 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF1P22415 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF1P22415 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF1P22415 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF1P22415 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF1P22415 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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