Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms