Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYN1P17600 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYN1P17600 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYN1P17600 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYN1P17600 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYN1P17600 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYN1P17600 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYN1P17600 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYN1P17600 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYN1P17600 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYN1P17600 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYN1P17600 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms