Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCK1P16333 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCK1P16333 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCK1P16333 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCK1P16333 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms