Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL2P13500 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms