Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms