Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms