Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMEM225BP0DP42 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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