Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRPRAP08240 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms