Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms