Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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