Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRATO95237 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRATO95237 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRATO95237 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms