Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms