Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX11O75558 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX11O75558 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX11O75558 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX11O75558 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX11O75558 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STX11O75558 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX11O75558 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX11O75558 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX11O75558 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX11O75558 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX11O75558 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX11O75558 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms