Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPLO60437 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPLO60437 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPLO60437 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPLO60437 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPLO60437 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms