Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKNO60260 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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