Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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