Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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KCNQ3O43525 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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KCNQ3O43525 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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