Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMC8O43402 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms