Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms