Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRODHO43272 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRODHO43272 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRODHO43272 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms