Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDM6AO15550 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms