Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms