Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CTDSP2O14595 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP2O14595 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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