Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBXN8O00124 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms