Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms