Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GGTLC3B5MD39 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms