Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A8MV72 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A8MV72 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A8MV72 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms