Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDR42E2A6NKP2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms