Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms