Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms