Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms